Wie Kolbenmotoren in V-Konfiguration können Motoren in Boxer- oder Flat-Konfiguration etwa halb so lang wie Motoren in gerader Konfiguration gebaut werden. Im Vergleich zu V-Motoren sind Boxermotoren nicht so hoch, was die Möglichkeit bietet, die Masse tiefer im Fahrgestell des Fahrzeugs zu positionieren, aber sie sind breiter.
Alle Boxermotoren zeichnen sich durch niedrige Primärschwingungen aus, da sich die Kolbenpaare gegenüberliegen und sich so bewegen, dass sie sich gegenseitig aufheben.
Wie Vs sind Boxermotoren komplexer als Reihenmotoren, sie haben 2 Zylinderköpfe mit zugehörigen Kopfdichtungen, Auspuffkrümmern usw., und die doppelte Anzahl von Nockenwellen, komplexere Nockenwellenketten oder Riemen und eine komplexere Kühlung.
Im Vergleich zu Vs haben Boxermotoren eine komplexere Kurbelwelle, da sie für jedes Pleuel eine Kurbelwelle haben. Echte V-Motoren haben Pleuelpaare, die sich jede Kurbelwelle teilen.
Der wahrscheinliche Grund, warum Boxer- oder Flat-Konfigurationen nicht sehr oft in modernen Autos verwendet werden, ist, dass ein Reihen- oder V-Motor fast immer die bessere Wahl ist.
Viele Autos haben heute Vorderradantrieb, der am besten mit einem kompakten, quer eingebauten Motor funktioniert. Ein Reihen-4 oder ein V6 sind in dieser Konfiguration viel besser geeignet als ein Flat-4 oder Flat-6.
Längs eingebaute Motoren werden bei Frontmotor und Hinterradantrieb bevorzugt, die geringere Masse des Boxermotors bietet wahrscheinlich nicht genug Vorteil gegenüber dem einfacheren Reihen-4 oder V6.
Wo Boxermotoren wirklich zu funktionieren scheinen, ist in luftgekühlten Fahrzeugen mit Heckmotor (z.B. VW Typ-1 und Porsche 911), wo die Breite weniger wichtig ist, der Motor so kurz wie möglich sein muss, um eine große Masse hinter der Hinterachse zu vermeiden, und die Zylinderreihen leichter zu kühlen sind, da sie weiter voneinander entfernt sind.
Im Hinblick auf das moderne Subaru-Layout, das ursprünglich 4-Zylinder-Motoren und Allradantrieb vorsah, ist ein längs eingebauter Boxer sinnvoll. Um die Vorderradantriebswellen unterzubringen, muss der Motor vor der Vorderachslinie platziert werden, und der kurze, niedrige Boxermotor hat Vorteile. (Man vergleiche dies mit dem originalen allradgetriebenen Audi 80 Quatro, der einen weit vor der Vorderachse hängenden Reihen-5er hatte).
Zu einem bestimmten Zeitpunkt wurden Flat-12-Motoren in Rennwagen wie dem Porsche 917 und vielen Ferrari F-1-Autos verwendet (obwohl diese technisch gesehen 180°-V-12s waren, die jeden beliebigen Zylinderbankwinkel haben können). Flat-12-Motoren erwiesen sich als inkompatibel mit Bodeneffekten, da die Zylinderköpfe den Raum einnahmen, in dem die Venturi-Tunnel sein mussten.